四月，朝廷決定由刑部尚書王紀、左都御史鄒元標、大理寺卿周應(yīng)秋組成三法司，會審熊廷弼和王化貞案。初審這天晚上，魏忠賢將審案過程記錄呈給了朱由校，這是東廠聽審的監(jiān)察員記錄的。
　　首先提審的是熊廷弼，熊廷弼先跪了三法司，然后就立刻站起來：“我起自田間，復(fù)任經(jīng)略，原議是讓我駐山海關(guān)，并無駐廣寧的片字決定。廣寧失守，罪在王化貞！”
　　左都御史鄒元標厲聲駁斥：“早就說過，失地喪城，功罪一體，你還想要推卸責(zé)任嗎？”因這是皇帝所說，所以熊廷弼沒辦法反駁。
　　接著熊廷弼又對“提審”他提出異議。鄒元標接著說：“本職屢奉明旨，內(nèi)云‘提審’，又有‘確審’字樣，你竟然不理！今日必須進刑部下獄，是非自明，你不可抗旨。”
　　熊廷弼不服，辯解說：“我奉明旨‘聽問’，不是‘送問’，寫得明明白白，怎能將我下獄？”
　　兩人爭論多時，刑部尚書王紀接過來說：“你不肯進刑部，就叫錦衣衛(wèi)旗尉陪你暫到天仙庵住一日，我們上奏皇上，請旨裁決?！?br/>　　熊廷弼無法，于是只好自請皇帝下詔逮捕他。
　　審?fù)晷芡㈠?，鄒元標、王紀都帶著客氣的口吻說：“請王巡撫過來。”
　　王化貞一進大堂，就長跪痛哭，說道：“我的苦唯有自己知道，一言難盡！”說著，從袖里取出一封信送上。
　　鄒元標、王紀都說：“你必須承認自己的罪過，將來一定還有重回朝班之日！”安慰了一陣，也沒細審，就都站了起來，與王化貞“一躬而散”。
　　朱由校問道：“這個鄒元標、王紀對兩人態(tài)度為什么大不相同，周應(yīng)秋為什么沒有說話?！?br/>　　魏忠賢小心回答：“回皇上話，鄒元標、王紀都是東林黨人，熊廷弼是楚黨，王化貞也是東林黨人，還是葉學(xué)士的弟子。周應(yīng)秋不是東林黨人，說話也不管用呀?！?br/>　　朱由校笑了起來，原來如此?？磥碜约荷鲜赖男畔⒂姓`呀，這東林黨人并不都是忠心耿耿的，明顯的黨同伐異，于是說道：“東林黨人竟然敢如此肆無忌憚偏袒自己人，打擊別黨的人士嗎？”
　　“小的曾聽人說，東林黨的左光斗曾經(jīng)說過一句話：若非同道，即為仇敵?！?br/>