大家終于扳倒了熊廷弼，大受鼓舞，覺得應該再接再厲，御史鄭宗周認為對崔文升處罰太輕，應該將他誅殺，并參首輔方從哲包庇崔文升，要他立刻退出內(nèi)閣。
　　然后刑部給事中魏應嘉參方從哲，認為在遼東邊事上內(nèi)閣的應對沒有一次切中要害，所做決定混亂并無作用，另有崔文升李可灼處罰太輕，責任都在方從哲身上，應該將方從哲罷掉。
　　看著象菜市場一樣的朝堂，朱由校只有苦笑。但方從哲他是準備保的，因為攻擊他的都是說崔文升和李可灼的事，而這事他都是親歷了的，責任并不在方從哲身上，所以所有的奏折都是留中不發(fā)，讓他們先吵著。
　　朱由校回到后宮里，接到了駱思恭派人送來的材料，錦衣衛(wèi)買通了張國紀家的一個仆婦，聲稱家中有事而讓錦衣衛(wèi)里的一個女諜代她進張府做事，所以張府舉動盡在錦衣衛(wèi)掌握之中。材料上對每個人的情況都有描述，其中張嫣的是：“郁郁寡歡，長期不發(fā)一言。”朱由校交待駱思恭派來的人，重點查探此女情況，愈詳細愈好，并注意保護此女安全。
　　孫傳庭接旨后于九月二十六回到京師。到了京師，先到兵部報到，剛剛辦好，宣他進宮的旨意已經(jīng)到了。
　　孫傳庭二十七八歲很精干的樣子，見過禮后，朱由校賜座。然后說道：“朕聽聞孫卿任職以來，辦事雷厲風行，行事得體。今日想聽一聽孫卿對我大明官兵有何看法?！?br/>　　“陛下，臣剛到兵部，不敢妄言。”
　　“姑妄言之，朕且聽之，我大明不以言罪人，孫卿盡管暢所欲言，無須顧忌太多。”
　　“那微臣就斗膽妄言了。我大明官軍，其弊有三，一者訓練太少，二者軍餉不足，三者軍中老弱多而青壯少。此三弊其實歸結(jié)一起，不過是一個錢字。朝廷軍餉其實是給了的，只是不知道進了哪些人的口袋。軍戶常淪為官吏豪強的奴隸，根本沒有多少戰(zhàn)力?！逼鋵嵰晕挠湟彩且淮蟊撞∩踔潦亲畲蟮谋撞?，但是他是文臣，巴不得如此，當然不會說。
　　“孫卿所言有理，朕欲整頓京營，不知孫卿可否助朕將京營打制成可戰(zhàn)之兵？”
　　天大的機會擺在面前，孫傳庭當然會死死地抓?。骸霸笧楸菹滦??！?br/>　　“好，卿且起來，朕任命卿為欽差京營清理大臣，賜你尚方劍，殺該殺之人，還朕一個干干凈凈，敢戰(zhàn)能戰(zhàn)的京營?！?br/>　　“清退無用之兵將，厘清軍餉之脈絡，現(xiàn)有京營魯游擊，周把總，是可信之人，能助你了解京營情況，你們先商量著，好生準備，明天朕就下旨了?！?br/>　　九月二十七，皇帝下旨，兵部職方司郎中孫傳庭任欽差京營清理大臣，賜尚方劍。這個欽差大家從來沒聽說過，不過既然是文官辦理武事，而且是從內(nèi)官手里搶的，文官們當然是樂觀其成。
　　孫傳庭并沒有直接去京營。他先向魯欽和周遇吉了解了一些基本情況。九月二十八，他進了京營，敲響了聚將鼓，鼓聲將盡，大堂之中，眾將分列兩旁，孫傳庭高坐于案前，手里拿著一封案卷，對著隊首二人道：“李總督，王協(xié)理，眾將可曾到齊？”