朱翊鈞讓李時珍進京，其實是相中了他所創(chuàng)造的人為分類方法，這是一種按照實用與形態(tài)等相似的生物和礦物，將其歸之于各類，并按層次逐級分類的科學方法。
　　
　　在朱翊鈞看來，李時珍能和祖沖之并列，在世界科學史上享有崇高地位，根本不足為奇?！侗静菥V目》雖然謬誤不少，但其科學分類方法比西方現(xiàn)代植物分類學創(chuàng)始人林奈的《自然系統(tǒng)》早了一個半世紀，被譽為“東方醫(yī)藥巨典”。對世界醫(yī)藥學、植物學、動物學、礦物學、化學的發(fā)展產(chǎn)生的深遠的影響，可謂無遠弗屆。
　　
　　后世的生物學學生，將界、門、綱、目、科、屬、種七種分類背的滾管爛熟，覺得天下萬物井井有條，想當然的就認為此種分類方法很簡單。
　　
　　殊不知在人類文明史上，分類學正是科學的萌芽之始。中國人之所以將科學命名為“科學”，即取意“反映自然、社會、思維等的客觀規(guī)律的分科之學”。一句話，無分科無以成學！
　　
　　華夏先民最早的生物分類記載于西周，比西方科學家林內(nèi)的生物分類方法少了兩種，卻領(lǐng)先兩千年。
　　
　　之后的中國分類學思想體現(xiàn)在諸多文獻之中，而最為璀璨的，即為《本草綱目》。無論其中記載了多少謬誤，僅在生物、礦物分類學上的思想，足以光耀千古。
　　
　　朱翊鈞在后世黨校的學習內(nèi)容，不僅是簡單的飛梭和珍妮機誘發(fā)工業(yè)革命之類的初中歷史。
　　
　　他記得很清楚，一次在黨校上課時，一個年輕的女教師旁征博引，講述了歐洲貴族和部分附庸風雅的資產(chǎn)階級，在地質(zhì)、礦物、生物乃至昆蟲等方面的愛好研究，大大促進了新的地理發(fā)現(xiàn)，并為現(xiàn)代科學奠基。
　　
　　后世工業(yè)革命和啟蒙思想催發(fā)的第一批成果，即為歐洲有閑階級流行的科學考察和探險。
　　
　　他們一方面資助數(shù)學家和科學家，一方面自己也從事地質(zhì)、礦物、生物等方面的粗淺研究，這直接誘導了化學和物理學的大踏步前進。而最開始的那批有錢人，都是從看似簡單的地質(zhì)、礦物和生物分類開始做起。
　　
　　后世達爾文曾受益于《本草綱目》，將之稱為“中國古代百科全書”?！笫赖哪承┲袊?，那些拿著《大英帝國百科全書》、《美國國家地理雜志》放在書房內(nèi)的附庸風雅之徒，何曾有一個在旁邊放著《墨經(jīng)》、《本草綱目》、《考工記》、《水經(jīng)注》、《夢溪筆談》、《天工開物》等等數(shù)之不盡的中華瑰寶？
　　
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　　朱翊鈞讓李時珍返京，除了要利用這個時代為數(shù)不多具有科學素養(yǎng)的大腦之外，還要利用他喜歡考證、鉆研的性格，從事對牛痘的研究。
　　
　　明代嘉靖初年之后，天花在帝國廣泛流行。朱翊鈞在萬歷二年初曾經(jīng)接奏報，寧國府有醫(yī)名傅思川者，掌握“人痘熟苗”之法，以為小兒種痘獲利，“百余小兒種痘，僅一、二不存?！?br/>　　
　　朱翊鈞不知道的是，從傅思川手中流傳出去的人痘術(shù)，簡直是以光速傳播到阿拉伯世界，又把西方從天花肆虐中給挽救了出來。
　　
　　人痘曾經(jīng)被大哲學家伏爾泰這般評價：“我聽說一百年來，中國人一直就有種痘的習慣；這是被認為全世界最聰明、最講禮貌的一個民族的偉大先例和榜樣?！痹谖鞣剿枷雴⒚砂l(fā)生之時，若沒有傅思川的人痘術(shù)，不知多少人才將死于天花病毒。