溫體仁知道崇禎皇帝最恨有人造反，這一塊是他的逆鱗，觸之即死，是以便唆使手下，一頂造反的大帽子扣了下去，只盼通過打擊孫元化，來實現(xiàn)打擊周延儒的目的。
　　這時只見御史余應(yīng)桂挺身而出，說道：“臣余應(yīng)桂，彈劾登萊巡撫孫元化，山東巡撫余大成，有負天恩，枉顧職守，致使孔有德叛亂，禍亂山東，危害社稷，首輔周延儒收受孫元化人參，貂皮賄賂，舉薦孫元化，也負有失察之責(zé)，也應(yīng)一并處分。”
　　兵科給事中李夢辰也站出附議，說道：“孔有德造反，一路殺官破縣，何以對孫元化另眼相看，輕輕放回，此必是孫元化與孔有德早有勾結(jié)，圖謀造反，皇上不可不察?！?br/>　　又有御史路振飛出列，稟道：“皇上，山東如今糜爛一片，山東巡撫余大成，登萊巡撫孫元化兩人乃是罪魁禍?zhǔn)祝渥锂?dāng)誅，又有首輔周延儒，包庇二人，意圖開脫，也應(yīng)一并獲罪，嚴(yán)加責(zé)罰?！?br/>　　周延儒氣得渾身發(fā)抖，但是他一向涵養(yǎng)甚好，過了片刻，平息了一下心情，這才出列說道：“皇上，臣從未接受過孫元化任何賄賂，臣之所以力保孫元化，也非想要包庇于他，實在是孫元化人才難得，當(dāng)初寧遠一戰(zhàn)，轟死老奴努爾哈赤的火炮，就是元化帶人建造，其人精通火炮，擅長鑄炮，火炮技術(shù)，在我大明無人能出其右?！?br/>　　停了停，他又繼續(xù)說道：“孫元化從師于徐光啟徐大人，孫元化為人如何，徐大人想必是最清楚不過的?！?br/>　　禮部尚書徐光啟此時也在場，此時他年歲已老，今年剛好七十歲，德高望重，深受崇禎皇帝信賴，聽聞周延儒提到自己的愛徒孫元化，心忖這次是躲不過去了，當(dāng)即也顫巍巍地出列說道：“皇上，老臣有話要說?！?br/>　　徐光啟歷經(jīng)萬歷，天啟，崇禎三任皇帝，堪稱三朝元老，便是崇禎也不能不給他個面子，當(dāng)即便溫言說道：“老大人有話請講?！?br/>　　徐光啟定了定神，方才說道：“孫元化乃是老臣門生，登州兵變，他御下不嚴(yán)，用人失察，其罪當(dāng)誅！”
　　“然而誠如周首輔所言，孫元化天資聰明，勤勤懇懇，自從上任遼東以來，直至登萊，一路裁減兵源，節(jié)省遼餉，為國家節(jié)省了大批銀錢，又安撫難民，研究西學(xué)，于火炮一道，頗有建樹，乃是難得的人才，所謂千軍易得，一將難求，雖然有罪在身，誅殺此人，一了百了，但是何不使他將功折罪，利用其擅長火炮的長處，為我大明繼續(xù)效力?！?br/>　　說完這一席話，已經(jīng)是氣喘吁吁，崇禎連忙使人看座。
　　這時次輔溫體仁也站了出來：“皇上，徐大人言之有理，周大人身為首輔，怎會收受賄賂，此必空穴來風(fēng)，信口雌黃，孫元化人才難得，皇上還是使他戴罪立功吧。”
　　崇禎原本深恨孫元化，原本山東一片太平，只因余大成，孫元化兩人無能，本來還想使二人派人增援祖大壽，結(jié)果按下葫蘆起了瓢，不但沒有救出來祖大壽，反而把原本平穩(wěn)的山東也弄得一片戰(zhàn)火，糜爛千里。