前情提示，不看劇透去玩游戲的話，會給你不一樣震撼感，從劇情上來講，不亞于黑魂的黑暗…
　　尼爾機械紀元中埃米爾笑的越開心，越欠打，玩了尼爾復制人的，就會越難受…
　　時間一下就過去了幾千年…
　　這期間也發(fā)生了一件大事，就是一位管理復制人的安卓帶著四位復制人單挑了最后的軍團boss紅眼，收集了所有的魔素后發(fā)到了異空間，到了龍背上的騎兵，零所在的世界，成了零眼里的滅世之花，死循環(huán)開始了....
　　前面說過了，人類創(chuàng)造了復制人來收集魔素，人類本身則格式塔化來躲避這種危機，由尼爾提供的魔素，來維持人類靈魂的穩(wěn)定。
　　十三對安卓系統(tǒng)管理著復制人，這個安卓系統(tǒng)就是復制人波波拉和狄波拉，也就是尼爾機械紀元里出現(xiàn)的紅發(fā)雙子姐妹。但是她們不是照顧尼爾的那一對，她們是另外十二對里的一對。
　　復制人無法生育，每次復制人死后，世界凈化機關就會提取人類（格式塔化后的人類）的魔素，制作新的復制人，投入戰(zhàn)場。
　　在漫長的死亡與投入的過程中，復制人誕生了自我的意識，并且在很短的時間內成長，他們開始以人類自居，而波波拉與狄波拉，成為了照顧他們的村長，這是悲劇的開始…
　　復制人尼爾也有一個妹妹，巧合的是復制人妹妹身體也不好，最要命的是，真人的靈魂崩壞的話，復制人的身體也跟著會患上黑紋病，就是那個天使死后把全世界逼上絕路的病。
　　前面說過，真妹妹早就出現(xiàn)了崩壞，世界凈化機關為了全人類能獲得尼爾穩(wěn)定的魔素供給欺騙尼爾，等到魔素被收集了發(fā)到另一個世界，等到人類回歸到復制人的身體里，就會救她。
　　真尼爾同意了，并且當了一個血包，一下當了幾千年…
　　但是后來出了問題，尼爾的妹妹崩壞加劇了（記得是），而且他的魔素供給也出了問題，獲得他魔素的人類本來可以維持靈魂穩(wěn)定的，但是在尼爾故事發(fā)生的時間點里崩壞了，也就是說，這個血包的血過了保質期了，沒用了…
　　真尼爾害怕妹妹會變成崩壞體，所以擅自行動了…
　　他搶了復制體尼爾的妹妹，打算讓自己的妹妹，進入到復制體的身體里…
　　尼爾復制者的劇情由此展開，尼爾為了救妹妹，踏上了討伐魔王的道路。
　　崩壞的人類靈魂被稱作是惡魔，被以人類自居的尼爾殺死了，那些沒有崩壞的人類靈魂…
　　也被尼爾殺死了…
　　這里說一句，這個時候就已經有智械了，智械很多是在保護人類的，不過被尼爾當做惡魔的爪牙，一起殺死了…
　　在旅途中尼爾遇到了凱尼…（不講她的故事了，和本書無多大關系，但…也是很悲劇的…很多人很喜歡這個萌妹的…）
　　以及，可能是此時最后的人類，實驗兵器七號，埃米爾…
　　埃米爾加入了打魔王的小隊。
　　埃米爾是一個很可愛很善良的小男孩，甚至善良的不正常，哈魯阿特別照顧他，為了保護他而暴走，摧毀實驗室，但最后埃米爾把她石化了…
　　本書出現(xiàn)的埃米爾不是正體，所以是女孩子，也很壞，行，滿足你（笑）
　　至于為什么不是正體，以后會講。
　　復制體尼爾手里握著白之書，但白之書失憶了，忘記自己應該與黑之書合體，讓所有人類回歸到復制體身體里的事。
　　它與尼爾在冒險中又產生了羈絆，記起自己責任的時候，選擇了拒絕與黑之書合體，因為那樣的話，復制體尼爾的人格就會消失，復制體尼爾，就會消失。
　　復制體尼爾帶著自己的小隊成員一路殺到了魔王的面前，被啵啵啦和狄波拉擋住，雙子姐妹把實情告訴了復制體尼爾，在絕望的喊著要復制人把身體還給人類的時候，與尼爾開戰(zhàn)了...
　　為了人類，還是為了自己的妹妹？
　　復制體尼爾選擇了妹妹。
　　真尼爾也會這么選擇。
　　尼爾殺死了她們，雙子姐妹其中一人的自爆，也把埃米爾炸飛了，生死未知....
　　最后復制體尼爾殺死真尼爾，救下了自己的妹妹。
　　你以為這是happyend?
　　不，一直以來的同伴凱尼魔化，復制體尼爾要么選擇殺死凱尼，要么獻出自己的存在救凱尼，到時候這個世界上的所有人，都不記得復制體尼爾...
　　救下了凱尼或者殺死凱尼也算是給凱尼一個解脫，雖然有點遺憾但也是happyend？
　　復制體尼爾殺死了真尼爾，所有的人類靈魂陸陸續(xù)續(xù)崩壞，人類從此滅絕。
　　復制體是沒有生育能力的，人類靈魂的崩壞沒辦法給世界凈化機關提供魔素制造復制人，復制人陸陸續(xù)續(xù)死了。
　　全滅結局。人類的基因與復制體的形體被發(fā)到月球基地保存了下來。
　　安卓士氣低落，守護的人類全部滅絕，安卓失去了存在的意義。
　?。ㄟ@里說一個原設定里的bug，背景中有說，在安卓控制力強的地方，復制體把身體歸還給了人類，也就是說，復制體尼爾摧毀了大部分人類，還有小部分人類活著，至于是個bug還是下了一盤大棋，看后續(xù)了...）