朱翊鈞開始主政時(shí)，對(duì)運(yùn)河的管理重視程度不是很夠。他畢竟不是經(jīng)濟(jì)學(xué)家，以前也沒研究過運(yùn)河歷史，因此心中對(duì)運(yùn)河在帝國(guó)治政方面的地位認(rèn)識(shí)高度沒有張居正、王國(guó)光等人高。
到了萬(wàn)歷三年，朱翊鈞對(duì)運(yùn)河的認(rèn)識(shí)高度終于和張居正拉平。主要原因?yàn)閮赡陙韽埦诱乳w臣對(duì)運(yùn)河管理的極度重視，凡有總漕奏章，張居正必然長(zhǎng)篇累牘的分析利弊，往往還要請(qǐng)見，潛移默化改變了朱翊鈞的想法。
張居正多次對(duì)朱翊鈞指出，因?yàn)榫煘榈蹏?guó)核心，軍、民人口稠密，華北平原的產(chǎn)出不足以供養(yǎng)，因此江南轉(zhuǎn)的運(yùn)糧米成了帝國(guó)命脈所系。
有一天張居正再次請(qǐng)示漕運(yùn)事的時(shí)候，對(duì)朱翊鈞形容漕糧的重要性時(shí)說道：“一日不得則饑，三日不得則不知其所為命?！边@句話讓朱翊鈞深感悚懼。
后世之人生活在物資極度豐富的年代，對(duì)物資緊缺缺乏感性認(rèn)識(shí)。朱翊鈞穿越到皇帝身上后，生活中的一些不便利的地方，包括后世的一些享用，都一一命張宏、張?chǎng)L等人予以解決。
朱翊鈞對(duì)生活品質(zhì)要求較高，例如衛(wèi)浴設(shè)施、日常生活用品的開發(fā)使用等事，這兩年已經(jīng)逐漸從宮中向外擴(kuò)散。除了家用電器朱翊鈞暫時(shí)沒辦法外，其余的享受和后世沒有太大差異。
正因如此且穿越到皇帝身上，朱翊鈞對(duì)民間的生活狀況了解的并不是太多。
各地情報(bào)和銀章直奏所述民間困苦情狀，文字高度概括，例如“人廬漂浮過萬(wàn)”或“大饑，餓殍滿地”之類，并無(wú)細(xì)節(jié)描述。朱翊鈞當(dāng)時(shí)看這些奏章，像是在看歷史文獻(xiàn)似的，并無(wú)切膚之感。
但是張居正當(dāng)日向他所說“三日不得則不知其所為命”時(shí)那恐懼的眼神，嚴(yán)肅的神情，讓朱翊鈞猛然發(fā)覺，盡管在這個(gè)世界已經(jīng)生活了兩年，自己與這個(gè)世界卻一直是疏離的。
這種感覺很荒謬，又很真實(shí)，像是一把匕首劃開了朱翊鈞穿越以來一直包覆著全身的軟膜一般，使他第一次產(chǎn)生了與這個(gè)世界產(chǎn)生了血肉聯(lián)系之感。
這種感覺在那日后，變得越來越清晰，體現(xiàn)在日常和兩宮、幼弟、妹妹等家人的聯(lián)系之間，體現(xiàn)在他與孫乾、魏朝等人一起生活的點(diǎn)滴之處，越來越把他同化、同感，使之與本時(shí)空的大明越發(fā)的共情、共鳴。
這時(shí)候的朱翊鈞，回首再看兩年來的施政，諸多孟浪之處一一浮現(xiàn)。
朱翊鈞反思自己，兩年來嘴上說著惕勵(lì)親民，但早就和人民群眾之間斷了血肉聯(lián)系，自己身上的本就不多的“黨性”早已千瘡百孔。
又反思自己，兩年來對(duì)待政事，如同在打游戲通關(guān)一樣，隨意的擺布著這個(gè)世界，卻忽略了自己每一道命令，都涉及著千萬(wàn)人生死存亡?！绻麜r(shí)間回?fù)艿絻赡昵埃芏嗍虑樘幚淼臅?huì)好很多。
把這種心境與剛穿越來那天經(jīng)筵時(shí)被權(quán)力迷醉時(shí)相比，朱翊鈞覺得自己進(jìn)階了。他對(duì)皇帝的身份認(rèn)同感越來越強(qiáng)，而對(duì)自己身上擔(dān)負(fù)著的使命與責(zé)任，認(rèn)識(shí)也越來越深刻。
以這種心態(tài)來看漕運(yùn)，朱翊鈞終于體會(huì)到了，這條大運(yùn)河的每一次變革，都關(guān)乎運(yùn)河兩岸數(shù)以百萬(wàn)計(jì)的生民身家性命。
若不能妥善處理化解矛盾，如同改革鹽政那般隨意興革，不知多少人將家破人亡。因此，他很慎重的先祭出法寶：調(diào)查研究。
隨著一件件調(diào)研報(bào)告的反饋，到了萬(wàn)歷三年六月份，朱翊鈞終于構(gòu)建出京杭運(yùn)河的整體印象。
總漕和中央、地方之間的關(guān)系，運(yùn)河上下的階層分布、賴以為生的人群結(jié)構(gòu)，運(yùn)河和各大水系之間的有機(jī)聯(lián)系，朝廷現(xiàn)在的漕運(yùn)體制有何種弊端，都事無(wú)巨細(xì)的勾勒出來，并最終讓他——一個(gè)與眾不同的皇帝，找出了解決問題的答案。
心里有了底，下一步就是統(tǒng)一思想。朱翊鈞正盤算時(shí)，屢敗屢戰(zhàn)的王宗沐于八月中再次建議朝廷，欲行海漕。
這下子可捅了馬蜂窩，伴隨著暴風(fēng)驟雨般的彈章，王宗沐這個(gè)總漕位子開始搖搖欲墜。朱翊鈞連續(xù)在各種場(chǎng)合放風(fēng)，下毛毛雨，保著王宗沐。同時(shí)下旨戶部，令其提出對(duì)再行海漕的意見。
八月三十，戶部奏章送六科備案后報(bào)內(nèi)閣，侍從室又將之列為朱翊鈞詳看之章。朱翊鈞見其內(nèi)容為：